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蛋白组学研究
Label free
        蛋白质非标记定量技术(label-free)是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱 分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,通过比较质谱分析次数或质谱峰强度, 分析不同来源样品蛋白量的变化。
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iTRAQ
        同位素标记相对和绝对定量iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)技术是由美国应用生物系统公司ABI研发的一种多肽体外标记技术。 该技术采用4种或8种同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,然后进行串联质谱分析,可同时比较4种或8种不同样品中蛋白质的相对含量,是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。
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SWATH
        SWATH(Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra)是瑞士苏黎世联邦理工学院的RuediAebersold博士及其团队与AB-SCIEX联合推出的一项全新的质谱技术。 SWATH采集模式是一种新型的MS/MS 扫描技术,它将扫描范围划分为以25 Dalton 为间隔的一系列区间,通过超高速扫描来获得扫描范围内全部离子的所有碎片信息,是 MS/MS ALL技术的扩展。SWATH技术是一种真正全景式的、高通量的质谱技术,同时也大大提高了定量的可重现性。 此外,借助先进的 Triple-TOF5600 plus 质谱系统,SWATH 在定量上具有较高的准确度和动态范围。
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Shotgun 蛋白鉴定
        shotgun(鸟枪法)LC-MS质谱鉴定蛋白混合物的一般流程为:将蛋白溶液经SDS-PAGE分离的目的条带酶切消化为肽段混合物,然后在高效液相色谱分离形成简单的组分,再在线或离线导入高分辨率质谱仪中进行分析。 肽段在质谱仪中离子化后,会带上一定量的电荷,通过检测器分析,可得到各肽段的质荷比(m/z),从而得知各肽段的相对分子质量。 为获得肽段的序列信息,质谱仪会选取某些肽段进行破碎,再次分析,获得二级质谱。 用检索软件选择相应的数据库对二级质谱分析,便可得到肽段的氨基酸序列,从而鉴定各蛋白质。
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