service@tgs.org.cn

0755-66814606

首页 >市场与支持 > 行业动态
环境微生物宏转录组测序
最先进的样品处理策略 最科学的实验研究方案
产品概述

      宏转录组测序从整体水平上研究某一特定环境、特定时期环境微生物群落的全部基因转录情况以及转录调控规律。宏转录组测序以环境微生物群落为研究对象,对环境样品中的全部RNA进行高通量测序,进行物种鉴定和功能基因研究,揭示特定环境条件下微生物群落的适应性以及基因表达可能的调控机制,与宏基因组研究相辅相成。


技术路线


恒创优势

  • 1、严谨的实验流程设计
    根据研究目的选择最可靠的建库策略;根据环境类型选择最优rRNA去除策略。
  • 2、先进的total RNA提取方法
    针对不同的环境样品,推荐最靠谱的样品采集策略和最先进的提取方法。
  • 3、专业的分析技术团队
    围绕特定的研究目的,共同制定最前沿、最科学的实验方案。
  • 4、 贴心的附加服务
    基于文章发表的需要,提供无与伦比的个性化分析服务,定制化结题报告及结果文件。

应用领域

环境微生物:土壤、水体、空气、矿地
人体微生物:口腔、鼻腔、肠道、生殖道、皮肤
农业微生物:动物肠道、根际微生物、植物内生菌
工业微生物:废水、污泥、发酵、酿酒、沼气
特殊环境微生物:极地、沙漠、火山

案例分享

研究对象发表杂志方法学主要结论
人肠道Nature16S V4+ITS1+宏基因组+生化检测1.在肉食饮食情况下,胆汁忍受能力强的菌有所增加,如Alistipes、Bilophila和Bacteroides;降解植物多糖的Firmicutes等有所降低;
2、通过食物中的微生物和特殊饮食后肠道微生物的比较,表明一些事物中的微生物能够在肠道中短期驻留;
3、短期饮食,尤其是全肉类饮食,会改变肠道菌群及代谢,提高了癌变、肠炎等问题。
水体Nature宏基因组通过对海洋水体进行宏转录组测序获得了大量基因组序列信息。包括了大量已知sRNA和未知的psRNA,不同组别间的差异反应了sRNA和psRNA参与了生态适应的过程
植物与微生物互作Nature宏转录组、单菌的基因组和转录组1、发现与藻类生长相关联的微生物物种;并用回添实验证明了微生物物种在藻类生长中的作用
2、证实了细菌与硅藻相互作用相关表达基因,并找到了相关物质的运输通路
3、找到了海洋中IAA生成相关基因
食品发酵Appl Environ Microbiol宏转录组构建记住主要物质的代谢通路

参考文献

  • 1、David LA,Maurice CF,Carmody RN,et al. Diet rapidly and reproducibly alters the human gut microbiome. Nature. 2014,505(7484):559-563.
  • 2、Shi Y,Tyson GW,DeLong EF.Metatranscriptomics reveals unique microbial small RNAs in the ocean's water column.Nature. 2009,459(7244):266-9.
  • 3、Amin SA, Hmelo LR, van Tol HM,et al.nteraction and signalling between a cosmopolitan phytoplankton and associated bacteria.Nature. 2015,522(7554):98-101.
  • 4、Weckx S, Allemeersch J, Van der Meulen R, et al. Metatranscriptome Analysis for Insight into Whole-Ecosystem Gene Expression during Spontaneous Wheat and Spelt Sourdough Fermentations . Applied and Environmental Microbiology. 2011,77(2):618-626.


服务
RNA产品
动植物重测序
微生物产品
表观产品
疾病研究
蛋白组学研究
科学
发表文章
关于我们
公司简介
文化与价值观
联系我们
招贤纳士
招聘需求
在线求职
扫一扫,关注我们
 

地址:深圳市盐田区大百汇科技园9层B区   

电话:0755-66814606

©2018 @深圳市恒创基因科技有限公司 粤ICP备14082833号